真双子叶植物基部类群昆栏树目(Trochodendrales)仅包含两个单种属,水青树属(Tetracentron)和昆栏树属(Trochodendron),是研究被子植物系统与进化的重要和关键类群之一。
与大多数被子植物相比,昆栏树目植物叶绿体DNA的反向重复区(IRs)包含了更多的基因,一般出现在大单拷贝区(LSC)的5个基因(rpl22, rps3, rpl16, rpl14, 和rps8)在昆栏树目植物叶绿体基因组中却位于反向重复区。
中科院武汉植物园系统与进化植物学学科组博士研究生孙延霞,基于对昆栏树目下仅有两个物种的叶绿体DNA全序列的测定,结合化石考证资料对水青树属和昆栏树属的分化时间进行了估算。他们发现,昆栏树目叶绿体基因组具有典型的被子植物叶绿体基因组结构(由大小单拷贝区以及两个反向重复区组成);目下仅存的两个物种的叶绿体DNA序列差异很小;二者的分化时间距今约44~30百万年,能较好地与已发现的昆栏树目的化石考证资料相吻合。另外他们还发现水青树(Tetracentron sinense)和昆栏树(Trochodendron aralioides)的叶绿体DNA含有丰富的SSR位点,并一一进行了定位,这为将来对这两种珍稀濒危植物的居群遗传学研究提供了宝贵的数据。
该研究为武汉植物园方向性项目资助。研究结果以Complete Plastid Genome Sequencing of Trochodendraceae Reveals a Significant Expansion of the Inverted Repeat and Suggests a Paleogene Divergence between the Two Extant Species为题发表在国际期刊PLoS ONE上。
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水青树叶绿体基因组