8月29日,应上海药物研究所朱维良研究员的邀请,牛津大学的Charlotte Deane教授来药物所进行学术交流,作了题为Predicting the shape and residues of the antibody binding site improves antibody-antigen docking的精彩学术报告。
报告主要从三方面介绍了抗体药物设计方面的工作,首先介绍了一个在线数据库SAbDab(Structural Antibody Database),通过从PDB收集抗体晶体结构,计算一些抗体的属性,发现了抗体与普通蛋白质的不同;其次,Deane教授介绍了用于预测VH-VL作用域取向的工具ABangle,这个工具是通过6种量度标准来表征VH-VL作用域的取向;最后,Deane教授详细介绍了用于预测抗体-抗原结合关键残基的工具i-Patch,这个工具在蛋白-蛋白相互作用过程中关键残基的预测方面有着不俗的表现,局部预测精度高达80%以上,全局预测(整个蛋白)精度超过40%,优于现有的工具。
Charlotte Deane是英国牛津大学结构生物信息学教授,研究领域涉及应用统计、数学和计算生物学等。擅长蛋白质结构预测和蛋白质相互作用网络,结合理论研究和实证分析方面的研究。
Charlotte Deane教授作报告